Совсем новые гены
Jun. 12th, 2018 09:33 am В интересной статье Diversity and evolution of the emerging Pandoraviridae family описывается исследование генетики гигантских ДНК вирусов. Эти вирусы, по размеру их ДНК сравнимые с бактериями, очень необычны. Я уже однажды писал про них пост https://marigranula.livejournal.com/154701.html. И вот авторы статьи высказывают гипотезу (и дают для нее серьезное обоснование): они предполагают что большая часть генов этих гигантских вирусов возникла не в результате дупликации или была захвачена в организме хозяина (обычные источники новых генов во всех организмах), а была синтезирована de novo за счет какого-то неизвестного процесса и имеет более-менее случайную последовательность. Очевидно, что ДНК с случайной последовательностью не могут кодировать что-то полезное. Почему же эти гигантские вирусы ( а большинство вирусов имеет супер компактные геномы с минимальным количеством генов) имеют так много случайных генов?
Ответ на этот вопрос может помочь разгадать и загадку, почему геномы эукариот содержат так много нефункциональной ДНК. Присутствие этой так называемой "мусорной" ДНК объясняется обычно слабой селекцией (эукариоты огромны, и относительная "стоимость" этой мусорной ДНК для эукариот невелика). Но для вирусов "лишняя" ДНК должна быть очень "дорогой", и селекция против нее должна быть соответственно сильной! Более того, у эукариот имеются вроде бы специальные механизмы, ограничивающие распространение "мусорной" ДНК, в то время как у гигантских вирусов существуют специальные механизмы для синтеза этой ДНК. Может быть, у этой лишней ДНК и у гигантских вирусов и у эукариот есть все таки какие-то функции, которых мы не знаем?
Ответ на этот вопрос может помочь разгадать и загадку, почему геномы эукариот содержат так много нефункциональной ДНК. Присутствие этой так называемой "мусорной" ДНК объясняется обычно слабой селекцией (эукариоты огромны, и относительная "стоимость" этой мусорной ДНК для эукариот невелика). Но для вирусов "лишняя" ДНК должна быть очень "дорогой", и селекция против нее должна быть соответственно сильной! Более того, у эукариот имеются вроде бы специальные механизмы, ограничивающие распространение "мусорной" ДНК, в то время как у гигантских вирусов существуют специальные механизмы для синтеза этой ДНК. Может быть, у этой лишней ДНК и у гигантских вирусов и у эукариот есть все таки какие-то функции, которых мы не знаем?