Большинство бактерий содержат плазмиды - относительно короткие ДНК, которые реплицируются независимо от бактериальной хромосомы. Плазмиды являются или паразитами или симбионтами бактерий и способны несколькими способами перемещаться из одной бактерии в другую. Многие плазмиды влияют на поведение бактерий.
Сейчас становится очевидно (Why do plasmids manipulate the expression of bacterial phenotypes?), что плазмиды делают поведение бактерий более кооперативным чтобы обеспечить заражение новых бактерий. Например, некоторые бактерии выделяют токсины которые убивают соседних бактерий того же вида. Некоторые плазмиды блокируют впрыскивание токсинов в соседей, что бы самим заразить соседей. Другие плазмиды индуцируют образование колоний бактерий, где опять таки шанс заражения соседних клеток гораздо выше, чем в случае свободноживущих бактерий. И неубийство соседей и образование колоний - это вроде бы кооперация между бактериями, но по факту - это именно стратегии облегчающие плазмидам заражение бактерий.
Кстати, плазмиды активно конкурируют друг с другом внутри самих бактерий. В интересной статье CRISPR-Cas systems are widespread accessory elements across bacterial and archaeal plasmids показывается, что многие плазмиды содержат гены кодирующие CRISPR-Cas систему, которая уничтожает чужеродное ДНК. Эти гены есть и в бактериальной хромосоме. Но если бактериальная хромосома кодирует CRISPR-Cas в основном против вирусов, то CRISPR-Cas плазмид направлен в основном против плазмид-конкурентов. По видимому, плазмиды инкорпорировали систему предназначенную для борьбы с вирусами и переориентировали ее на борьбу с конкурентами.
Сейчас становится очевидно (Why do plasmids manipulate the expression of bacterial phenotypes?), что плазмиды делают поведение бактерий более кооперативным чтобы обеспечить заражение новых бактерий. Например, некоторые бактерии выделяют токсины которые убивают соседних бактерий того же вида. Некоторые плазмиды блокируют впрыскивание токсинов в соседей, что бы самим заразить соседей. Другие плазмиды индуцируют образование колоний бактерий, где опять таки шанс заражения соседних клеток гораздо выше, чем в случае свободноживущих бактерий. И неубийство соседей и образование колоний - это вроде бы кооперация между бактериями, но по факту - это именно стратегии облегчающие плазмидам заражение бактерий.
Кстати, плазмиды активно конкурируют друг с другом внутри самих бактерий. В интересной статье CRISPR-Cas systems are widespread accessory elements across bacterial and archaeal plasmids показывается, что многие плазмиды содержат гены кодирующие CRISPR-Cas систему, которая уничтожает чужеродное ДНК. Эти гены есть и в бактериальной хромосоме. Но если бактериальная хромосома кодирует CRISPR-Cas в основном против вирусов, то CRISPR-Cas плазмид направлен в основном против плазмид-конкурентов. По видимому, плазмиды инкорпорировали систему предназначенную для борьбы с вирусами и переориентировали ее на борьбу с конкурентами.