Маленький, да удаленький

[marigranula]

      В интересной статье Miniaturization, Genome Size, and Biological Size in a Diverse Clade of Salamanders проливается новый свет на эволюцию размера генома.
      Саламандры обладают огромными геномами. Даже самый маленький геном саламандры в три раза больше человеческого, а самые крупные - в десятки раз больше. Большую часть генома саламандра составляют так называемые транспозоны, то есть участки ДНК способные "размножаться" и перемещаться внутри генома, хотя и интроны у саламандр в среднем длиннее, чем у других позвоночных.. С чем связано такое большое количество транспозонов в геноме саламандр непонятно. У летающих позвоночных (птицы и летучие мыши) геномы очень маленькие, что наводит на мысль о том что необходимость в экономии массы может приводить к эволюции маленьких геномов.
Авторы статьи исследовали 60 видов саламандр, вплоть до самых маленьких:

      Они выяснили, что
1.Уменьшение размеров саламандр идет в основном за счет уменьшения размера клеток, а не их количества
2.У саламандр с меньшими клетками, меньше размер генома.
Не понятна, правда, причинно-следственная связь: уменьшение размеров клеток приводит к уменьшению размера генома, или маленький геном позволяет клеткам миниатюризироваться.
      Вообще, было бы интересно сравнить размер сперматазоидов и размер геномов у различных видов: во многих случаях, есть селективное давление ведущее к уменьшению размеров сперматозоидов, что может, в свою очередь, вести к уменьшению генома за счет потери транспозонов.

Comments

[rider3099.livejournal.com]

Очень любопытно

[marigranula.livejournal.com]

[agasfer.livejournal.com]

Эта область вообще темный лес пока что.

[freedom_of_sea.livejournal.com]

большой геном дает плюс к изменчивости

[marigranula.livejournal.com]

В случае с саламандрами, речь идет о том, что уменьшение размера генома происходит из-за уменьшения количества транспозонов, которые конечно эволюционируют, но их "вклад" в эволюцию генов минимален.

[marigranula.livejournal.com]

Ну вот просветляется потихоньку....

[agasfer.livejournal.com]

Так ответа на вопрос "зачем" все равно нет.

[marigranula.livejournal.com]

Вы про функции "мусорной" ДНК?

[agasfer.livejournal.com]

Ну да.

[marigranula.livejournal.com]

Да, это мне тоже кажется самым интересным. Я собственно поэтому и выложил пост, потому что статья приближает нас к ответу на этот вопрос.
Стандартный ответ, собственно - weak selection.

[abyssal-being.livejournal.com]

Мне кажется, транспозоны - это такое древнее явление, которое тянется еще от горизонтального переноса генов у бактерий, и чем сложнее существо, тем меньше их должно бы оставаться. Кажется.
Да! Про сперматозоиды разных видов было бы интересно!
А про экономию генома у летающих - очень интересно

[marigranula.livejournal.com]

У клеток есть специальные системы борющиеся с размножением транспозонов.
Но вообще, количество транспозонов сильно варьируется у разных видов - никто не знает толком почему, и почему, как ты заметила, они не были в конце концов истреблены вообще полностью.

[abyssal-being.livejournal.com]

Да! Почему не полностью. Я еще докопаюсь когда-нибудь.
Дима, а ты слышал про такое, что в самых филогенетически древних белках находят что-то, чему в белке делать нечего, и это отголоски самой древней формы жизни, доклеточной? Мне про это толковали.

[marigranula.livejournal.com]

"Дима, а ты слышал про такое, что в самых филогенетически древних белках находят что-то, чему в белке делать нечего, и это отголоски самой древней формы жизни, доклеточной?"
Нет, это просто не реально.
Может, речь шла об интронах в генах, кодирующих белки?

[abyssal-being.livejournal.com]

спасибо, что подумал над вопросом. Но они говорят, именно в белках.