(no subject)

[marigranula]

Она мне: "Уйди!",
Мол, мы впереди
Не хочем с мужчинами знаться
А будем теперь почковаться!

      Хотя многие виды животных способны к партеногенетическому размножению, только немногие размножаются исключительно партеногенетически. Чем именно сексуальное размножение лучше асексуального является одним из важнейших вопросов эволюционной биологии. Хотя было предложен целый ряд гипотез объясняющих существование секса, они не получили надежного эмпирического подтверждения
      В интересной статье Convergent consequences of parthenogenesis on stick insect genomes проводится сравнение геномов пяти партеногенетически размножающихся видов палочников с пятью близкими видами палочников размножающихся половым путем. Авторы выяснили, что партеногенетические виды возникали независимо, и разница в ДНК между видами с разным способом размножения по факту мала. Гены у палочников, размножающихся половым путем, в среднем эволюционируют немножко быстрее, чем у партеногенетических видов, но это может быть связанно с сексуальным отбором [*], который отсутствует у асексуально размножающихся видов. Дополнительные исследования необходимы, чтобы определить реальные функции этих быстрее эволюционирующих генов. В остальном, геномы всех палочников оказались довольно похожи, включая близкое количество транспозонов.
Авторы статьи связывают распространенность партеногенеза у палочников с тем что у них нет крыльев и они живут в местах где много лесных пожаров, соответственно асексуально размножающиеся и немобильные виды быстрее будут заселять новые территории (в условиях низкой плотности популяции, у асексуальных видов нет нужды в поисках партнеров). Но асексуальные группы других животных очень сильно разнятся в плане экологии.
Некоторые животные (например удильщики) живут в условиях очень низкой плотности популяции и при этом продолжают сохранять сексуальное размножение


* Гены связанные с сексуальным отбором эволюционируют очень быстро.

Comments

[cmpax-u-pagocmb.livejournal.com]

Выгодная стратегия для палочников.
Либо те, либо другие будут успешны, и экосистема без палочников не останется.

[agasfer.livejournal.com]

Дык, основное число мутаций происходит не при копировании хромосом, а при кроссинговере. Поэтому, частота мутаций при половом размножении и выше.

[mmnt.livejournal.com]

Хочу выразить вам признательность за то, что пишете про палочников, и не лезете в украинскую войну. Очень верный подход. Жил бы в Израиле, поступил бы аналогично.

[marigranula.livejournal.com]

Где страсти, где ярость и ужасы,
где рать ополчилась на рать,
блажен, в ком достаточно мужества
на дудочке тихо играть.

[marigranula.livejournal.com]

Не, большинство мутаций вносится в процессе деления предшественников сперматозоидов.
Кроссинговер эти мутации "перемешивает".

[marigranula.livejournal.com]

При том, что палочники давно потеряли крылья. Необычная для насекомых ситуация. У большинство насекомых хоть некоторые особи, но летают.

[agasfer.livejournal.com]

Ну коли дело обстояло так, то скорость мутаций была бы равной для всех хромосом. А она в 2 раза ниже для Х хромосом, которые вступают в кроссинговер только в 1/2 случаев, и на порядок ниже для У хромосом, которые вообще в кроссинговер не вступают.

[marigranula.livejournal.com]

Не-не, частоту мутаций определяли и у соматических клеток где кроссинговера не происходит. Частота мутаций мало зависит от рекомбинации но сильно зависит от количества делений которые претерпевает клетка. Поэтому сперматозоид несет больше мутация чем женские половые клетки.

[agasfer.livejournal.com]

Ну так соматические мутации по наследству не передаются. Зачем их вспоминать в контексте вашего поста?

[marigranula.livejournal.com]

Ну это показывает что основным источником мутаций является репликация, как и сравнение накопления мутация в сперматазоидах и женских половых клетках.

[agasfer.livejournal.com]

Нет, не показывает, каждому свое. Репликация--только для У-хромосом и для мтДНК. Погуглите тему в ПабМеде, все оценки скорости мутаций можно найти. Подчеркну, что речь о точковых мутациях (SNP), а не о быстро мутирующих LTR, которые ничего не кодируют. Как происходят мутации в повторах, я не помню, но эволюционный смысел их не понятен.

[marigranula.livejournal.com]

Вы читали статью, где показывается что частота мутаций Y хромосомы per generation ниже чем X хромосомы?
Я просто не дома. Вы можете сбросить ссылку?

[agasfer.livejournal.com]

Да у меня ПДФы где-то валялись, но это надо рыться по цифровым архивам, на каком-то хранилище, типа одной из многих Лэйси. У меня 5 или 7 компов сменилось с той славной поры, когда я с У-хромосомными мутациями работал. Ссылки легко находятся, типа https://www.nature.com/articles/ng.3171 но там вход платный. Сделайте одолжение, поищите сами, а то мне опять в дорогу собираться.

[marigranula.livejournal.com]

Авторы указывают на примерно одинаковую частоту мутаций:
Another explanation could be that a subset of damaged nucleotides
in PAL sequence are corrected back to their ancestral state through
gene conversion between paralogous sequences of the palindrome
arms before they can be transmitted to offspring via sperm as de novo
mutations8,9. Consistent with this interpretation, gene conversion is
thought to be much less widespread in the XDG, XTR and rAMP
sequence classes25–27. Indeed, as gene conversion is part of the cell’s
DNA repair repertoire, such events may be biased toward the fraction
of de novo mutations that stem from DNA damage. Interestingly, the
PAL mutation rate was not statistically different from that of paternally transmitted autosomal chromosomes at 7.2 × 10−10 PPPY, 95%
CI = 6.41 × 10−10 to 8.14 × 10−10 PPPY (based on five father-child
transmissions)1. Both autosomal chromosomes and PAL sequence
are subject to gene conversion (mostly allelic and non-allelic,
respectively), whereas most of the remainder of the MSY is not. We
therefore speculate that the difference in mutation rate between the
PAL sequence and non-recombining MSY provides a measure of the
additional damage-mediated mutation burden that is removed by
DNA repair through gene conversion.