marigranula: (Default)
[personal profile] marigranula
Вирус, вирус, вирус злой,
Не ходи ко мне домой!
Не води с собой микроба -
Не нужны мне здесь вы оба!
Мне без вас так хорошо,
И привольно, и легко.
С вами же - одна морока!
Отчего же вас так много?
(мое)

      В интересной статье Bacteriophage Cooperation Suppresses CRISPR-Cas3 and Cas9 Immunity описывается "кооперация" между бактериофагами в процессе их атаки на бактерии.


(scientist)
Дело в том,что большинство бактерий обладает иммунной системой, способной разрушать виральную ДНК. С другой стороны, многие бактериофаги синтезируют протеины, ингибирующие эту иммунную системы (не известно как они это делают, правда). Интересно, что для того чтобы преодолеть иммунную защиту бактерий, зачастую одного вируса оказывается недостаточно. Первый атакующий вирус погибает, но при этом ослабляет иммунную систему атакуемой бактерии, что позволяет второму вирусу начать успешно в этой бактерии реплицироваться.
      Является ли эта совместная атака реальной кооперацией или это просто совпадение? И почему тогда бактериофаги не содержат больше ДНК кодирующей протеины разрушающие иммунную систему бактерий? Ведь вирусы могут достигать огромных размеров (например, мимивирусы)? И интересно бы проверить, выделяют ли атакованные бактериофагами бактерии сигнальные молекулы, предупреждающие других бактерий о необходимости увеличить производство макромолекул обеспечивающих иммунную систему? В любом случае, мы видим постоянную битву между бактериями и бактериофагами.

Date: 2018-07-21 07:41 am (UTC)
From: [identity profile] theotherme1.livejournal.com
Самый общий ответ на твои вопросы это: "для эволюции и так сойдёт". Она же не швицер)

Date: 2018-07-21 08:44 am (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com
Неа, нет такой вещи как "так сойдет" для эволюции - там жесткая конкуренция.

Date: 2018-07-21 10:32 am (UTC)
From: [identity profile] theotherme1.livejournal.com
"Так сойдёт" в смысле: никто не будет улучшать вид, если он выживает. Выживания достаточно.

Date: 2018-07-21 04:58 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com
Не совсем так...
Грубо говоря, представь себе что жирафы достигают высоты 5 метров. Затем появляется жираф высотой 6 метров. Он начинает конкурировать с 5 метровыми жирафами за листву на высоте до 5 метров, и когда ее остается настолько мало, что 5 метровому жирафу не хватает прокормится, он вымирает. А вот 6 метровый будет продолжать кормится листвой с 5 до 6 метров. В реальности все несколько сложнее, но смысл именно такой. Растения имеющие более длинные корни вытесняют растения имеющие более короткие корни.

Date: 2018-07-21 06:45 pm (UTC)
From: [identity profile] theotherme1.livejournal.com
Я знаю, как работает естественный отбор) Я о том, что если 5-метровому жирафу будет достаточно еды, то он не вымрет. Разве что будет чувствовать себя карликом рядом с 6-метровым.
Вот смотри: в среднем женщины менее сексуальны, чем мужчины. Если бы эволюция была перфекционисткой, а не рандомальным явлением, она бы довела это дело до совершенства, дав женщинам сексуальность, аналогичную мужской. Но зачем? Человеческий род и так выживает. Природе чихать на страдания женатых мужчин, месяцами на голодном пайке.

Date: 2018-07-21 07:32 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com
"Я о том, что если 5-метровому жирафу будет достаточно еды, то он не вымрет. Разве что будет чувствовать себя карликом рядом с 6-метровым."
5-метровому жирафу будет не хватать еды, если рядом с ним будут жить 6 метровые.
Представь себе, что есть лес с 1000 деревьями, причем 5метровому жирафу что бы прокормится нужно 100 деревьев. Соответственно в лесу живет 10 жирафов. Если один раждается или мигрирует, то на каждого жирафа уже приходится 90 деревьев, они начинают голодать, один умирает от голода, и опять деревьев становится по 100 на каждого. Представь себе, что рождается 6 метровый жираф. Ему достаточно 80 деревьев что бы прокормится (он же имеет доступ к 6 метру дерева и собирает с каждого дерева больше листвы). Жирафов 11, но голодают то только 10 из них. И умрет один из 10 5 метровых жирафов. Если потом родится еще один жираф, то умрет от голода 5 метровый жираф, а все 6-метровые будут выживать. В конце концов в лесу вместо 10 5 метровых жирафов будет 14 6 метровых жирафов с 70 деревьями на каждого. Модель очень упрощенная, но тем не менее демонстрирует. Тот же эффект будет, если появится новый жираф иммунный к каким то болезням: он не будет тратить ресурсы на болезнь и соответственно ему будет достаточно 90 деревьев, и т.д.

" в среднем женщины менее сексуальны, чем мужчины. Если бы эволюция была перфекционисткой, а не рандомальным явлением, она бы довела это дело до совершенства, дав женщинам сексуальность, аналогичную мужской. "
Женщина получает очень мало от своей сексуальности - ей надо забеременеть, и все. А вот мужчина, чем больше женщин оплодотворит, тем потомства у него больше. У него должен быть сильный стимул заниматься сексом.
Более того, вспомним о конкуренции спермы - если у женщины несколько партнеров, она может забеременить от каждого из них. И вот чем больше мужчина ввел в нее спермы, тем больше у него шанс, что именно он, а не конкурент, оплодотворит ее.
На самом деле, не все так просто как я описал. Например у грызунов клитор охватывает влагалище целиком. Расположение и размер клитора у человека "хуже" чем у остальных приматов.
Я даже по этому поводу высказал гипотезу: https://marigranula.livejournal.com/195664.html (https://marigranula.livejournal.com/195664.html)

Date: 2018-07-21 07:47 pm (UTC)
From: [identity profile] theotherme1.livejournal.com
Ты не понял. Я в целом говорю. Давай сравним с программированием. Вот надо имплементировать алгоритм. Можно сделать это красиво и чисто, чтобы минимально перегружать память, чтобы с точки зрения безопасности было идеально и т.д. А можно по-тупому, с кучей багов. Так вот при естественном отборе, если несмотря на кучу багов, вид выживет, то он и победил на данный момент с точки зрения эволюции.

Date: 2018-07-22 04:39 am (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com
"при естественном отборе, если несмотря на кучу багов, вид выживет, то он и победил на данный момент"
Представь себе ситуацию, что имплементировать алгоритм поручили паралельно нескольким программистам. Кто лучше всех сделает, того оставят, а остальных уволят. Останется тот кто сделает не лучший возможный вообще, а лучший остальных, даже если и с кучей багов.
Идут два туриста. Вдруг им навстречу медведь. Один бросается бежать. В торой ему - но ты же все равно бежишь медленнее медведя. Первый - но зато я бегу быстрее тебя.
Както так :)

Date: 2018-07-22 07:06 am (UTC)
From: [identity profile] theotherme1.livejournal.com
Если в его среде обитания не приходится убегать от медведей, то естественный отбор не отсеет плохо бегающих. Или же если да приходится, но не слишком часто, до будет выживать большой процент плохо бегающих. Механизм оптимизирован для определённой среды, при сохранении минимальной энтропии.

Date: 2018-07-22 10:43 am (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com
Смотри, проводились например такие эксперименты:
Бактерии помещались в среду с сублетальной концентрацией антибиотика. Гибнуть они не гибли, но делились они очень медленно. И вот в процессе эволюции, эти бактерии были целиком вытеснены быстрее делящимися мутантами. Механизмы защиты у мутантов были разные - какие-то синтезировали насосы, которые удоляли антибиотики из клеток в окружающую среду, у каких-то сами ферменты которые ингибировались этими антибиотиками изменились так, что перестали ими ингибироваться - но в любом случае начальные бактерии были полностью вытеснены.
Бактерии помещались в среду с источником углерода к которому они не были адаптированы. Опять таки, погибать - они не погибали, но делились очень медленно. И они были в процессе эволюции замещены мутантами которые эффективно утилизировали этот новый источник углерода.

Date: 2018-07-21 10:54 am (UTC)
From: [identity profile] home-lynxy.livejournal.com
Нет, это явно не совпадение, а работа вырусной распределенной сети...
Вы читали "Непобедимый" Лема?

Date: 2018-07-21 11:51 am (UTC)
From: [identity profile] soft-copy.livejournal.com
А, так вот он какой, жидкий Терминатор-2.0!
Edited Date: 2018-07-21 11:52 am (UTC)

Date: 2018-07-21 09:47 pm (UTC)
From: [identity profile] home-lynxy.livejournal.com
- После выполнения задания вас всех ждет большой пост!
- Спасибо-спасибо, терминаторы не постятся... :)

Date: 2018-07-21 04:13 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com
Читал, но не верю, что эволюция могла привести к такой кооперации...

Date: 2018-07-21 04:50 pm (UTC)
From: [identity profile] home-lynxy.livejournal.com
У меня на макетах очень быстро наступает самоорганизация...

Date: 2018-07-21 04:59 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com
Да? А что за макеты?

Date: 2018-07-21 09:43 pm (UTC)
From: [identity profile] home-lynxy.livejournal.com
Скажем так - компактные взаимодействующие вирусоподобные программы :)

Date: 2018-07-21 12:06 pm (UTC)
From: [identity profile] soft-copy.livejournal.com
Эволюция страшная штука. У меня какие-то мрачные аналогии напрашиваются.
Как-то так: внедрение вирусами своей ДНК в бактериальную клетку сходно с половым размножением высших растений и животных.
Сперматозоиды животных тоже кагбэ "кооперируются", причём вся команда работает на своего Марадону - когда он закатил мяч - остальные расслабляются по хмимическому свистку оплодотворенной яйцеклетки, гейм овер.
Я брежу?

Date: 2018-07-21 04:11 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com
"внедрение вирусами своей ДНК в бактериальную клетку сходно с половым размножением высших растений и животных. "
Вообще говоря, вирусы переносят гены между различными организмами. Это доказано в случае бактерий, но предполагается, что подобные процессы происходят и в растениях и животных.

"Сперматозоиды животных тоже кагбэ "кооперируются"
Да, у грызунов и муравьев сперматозоиды соединяются специальными крючками в группы, и вместе в связке плывут быстрее.

Profile

marigranula: (Default)
marigranula

March 2026

S M T W T F S
1 2 3 4 5 6 7
8 9 1011121314
15161718192021
22232425262728
293031    

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Mar. 10th, 2026 06:52 pm
Powered by Dreamwidth Studios