И мы когда-то были рыбы
Jan. 18th, 2021 08:49 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
marigranula В интересной статье Giant lungfish genome elucidates the conquest of land by vertebrates описывается определение последовательности генома двоякодышащей рыбы.
Геном оказался огромным, почти в пятнадцать раз больше человеческого. Авторы подтвердили, что двоякодышащие рыбы, которые были широко распространены в Девоне, но сейчас представлены всего шестью видами, являются самым близкими родственниками наземных позвоночных, с общим предком жившим 420 миллионов лет назад. Авторы также обнаружили обилие генов связанных с чуством обоняния на воздухе и уменьшение количества генов связанных с обонянием в воде.
Интересно, что позвоночное, занимающее второе место по размеру генома - аксолотль, по многим физиологическим и экологическим характеристикам близок к двоякодышащим рыбам. Трудно сказать, повлияло ли это на размер генома, или это просто совпадение.
Геном оказался огромным, почти в пятнадцать раз больше человеческого. Авторы подтвердили, что двоякодышащие рыбы, которые были широко распространены в Девоне, но сейчас представлены всего шестью видами, являются самым близкими родственниками наземных позвоночных, с общим предком жившим 420 миллионов лет назад. Авторы также обнаружили обилие генов связанных с чуством обоняния на воздухе и уменьшение количества генов связанных с обонянием в воде.
Интересно, что позвоночное, занимающее второе место по размеру генома - аксолотль, по многим физиологическим и экологическим характеристикам близок к двоякодышащим рыбам. Трудно сказать, повлияло ли это на размер генома, или это просто совпадение.
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2021-01-19 01:23 am (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 04:53 am (UTC)Современные двоякодышащие идут правильной дорогой,
no subject
Date: 2021-01-19 01:15 pm (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 01:26 pm (UTC)У него вроде с плавниками еще хуже, а вполне ничего нормальная рыба, даже током бьется.
no subject
Date: 2021-01-19 01:29 pm (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 01:41 pm (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 01:52 pm (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 02:06 pm (UTC)Кстати, а неплохо было бы, если бы все плавники девонского в конечности бы эволюционировали...
no subject
Date: 2021-01-20 05:47 am (UTC)no subject
Date: 2021-01-20 06:34 am (UTC)Так у целоканта, мне кажется, легкие деградировали и заполнены жиром. Ими не подышешь.
Лучше ползать как змея и дышать, чем наоборот.
Вообще, я подумал, что можно цепляться за что то плавниками и подтягиваться, и так перемещаться по суше...
Я так перемещался на машине по болоту - лебедка цепляется за что-нибудь, машина подтягивается, ну и так далее. Медленно конечно....
no subject
Date: 2021-01-19 06:53 am (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 06:58 am (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 07:16 am (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 07:29 am (UTC)Легкие возникли уже у общего предка всех костных рыб, но просто в лучеперых рыбах они трансформировались в плавательный пузырь (а у современного целаканта деградировавшее легкое заполнено жиром, по видимому тоже для плавучести). У кистеперых рыб тоже были изначально легкие, и плавники древних двоякодышащих тоже близки к ногам наземных позвоночных.
no subject
Date: 2021-01-20 08:11 am (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 07:59 am (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 08:15 am (UTC)ДНК прочнее а мембраны жирнее. То есть вопрос - если от этого счастья можно избавится, то почему таскать с собой весь этот хлам? Или все таки не хлам?*В случае с клещами таки играют, самые маленькие клещи потеряли кучу генов вполне функциональных в клещах побольше.
no subject
Date: 2021-11-18 02:41 pm (UTC)А эволюция запросто может имитировать индусского программиста: если выяснилось, что в программе нужно вставить дополнительный переключатель if, который поменяет выполнение отдельных блоков синтеза белков с зимней резины на летнюю, проще не искать то место, где реально происходит развилка, а вставить этот if в самом начале: "if я рыба, then (старый отлаженный код), else (новый код, полученный копипейстом с несколькими исправлениями". Как только коды стали писать в текстовых редакторах, отказавшись от перфокарт и перфолент, такая техника стала массовой. Чем эволюция глупее индусского постдока?
no subject
Date: 2021-11-18 02:51 pm (UTC)no subject
Date: 2021-11-18 03:08 pm (UTC)Это абсолютные или относительные цифры? В моей (супернаивной!) версии относительная доля junk DNA в обоих случаях должна быть примерно одинаковой. А как можно приспособить удвоенное количество мусора для каких-либо полезных целей за микроскопическое время — загадка.
Как, впрочем, и всё, что касается junk DNA. Один из наших молодых гениев когда-то поразил учёную общественность, найдя придуманными им статистическими методами куски в несколько сот нуклеотидов, которые сохранялись в генеалогических линиях дрожжей со времён царя Гороха (самые ранние расшифрованные ископаемые образцы) как раз среди apparent junk.
no subject
Date: 2021-11-18 03:22 pm (UTC)Я точные цифры не знаю, но чисто для иллюстрации, у птиц junk DNA — 50%, у человека — 70%, а у двоякодышащей рыбы — 95%. А поскольку не junk DNA варьируется в гораздо меньших пределах между видами, то и получается, что у двоякодышащей рыбы геном огромадный и именно за счет junk DNA.
no subject
Date: 2021-11-18 03:33 pm (UTC)Видимо, за (непод)отчётный период что-то стало понятно про трёхмерную структуру ДНК/РНК, и некоторое количество подозреваемых бездельников признали общественно полезными.
Читали ли вы недавнюю книжку Миши Громова? про то, что рациональный мозг ("математик") может понять в биологии? Миша вообще-то большой оптимист, и в математике его визионерство за несколько десятилетий оказалось вполне оправдано. Но в биологии он явно опускает руки...
no subject
Date: 2021-11-18 03:44 pm (UTC)Я от балды цифры называл, но да, части ДНК, которая считалось ранее не имеющей никакой функции, сейчас приписываются определенные функции. Например, совсем недавно была статья о том что ретроэлементы в геноме сумчатых могут использоваться для распознавания вирусов, и т.д. Ну или часть интронов транскрибируется, то есть, они тоже не совсем бесполезны.
"Читали ли вы недавнюю книжку Миши Громова?"
Нет. А как называется?
no subject
Date: 2021-01-19 09:06 am (UTC)были и студенты, не имеющие доступа к передовым кодам. а потому в некоторых днк имеется много хлама.
"я его слепила, из того что было."
no subject
Date: 2021-01-19 09:13 am (UTC)Проектировщика в студию!
no subject
Date: 2021-01-19 09:16 am (UTC)no subject
Date: 2021-01-19 09:18 am (UTC)Сами себя получше не могли спроектировать??
no subject
Date: 2021-01-19 09:19 am (UTC)