I Sing the Eel Electric
Dec. 5th, 2023 11:09 pmВ продолжение https://marigranula.livejournal.com/609156.html. В этом посте я обсуждал перенос генов между организмами. Обычно гены переносятся или вирусами или в процессе переваривания от еды к скушавшему. Еще один метод переноса ДНК - с помощью электричества, этот метод в частности в лабораториях. И вот в интересной статье Electric organ discharge from electric eel facilitates DNA transformation into teleost larvae in laboratory conditions показывается, что если поместить личинок данио-рерио в контейнере с раствором ДНК в аквариум к электрическому угрю и спровоцировать угря на разряд тока, то ДНК попадает в клетки личинок данио-рерио. Так электрические рыбы могут помочь переносу ДНК между видами. А ведь не только угри, но и электрические скаты делают электрические разряды, и это может способствовать обмену генами между морскими обитателями.
ps Удары молний в почву вызывают перенос генов в почвенные нематоды.
UPD
penetrat0r заметил, что тазеры могут переносить гены в преступников.
ps Удары молний в почву вызывают перенос генов в почвенные нематоды.
UPD
no subject
Date: 2023-12-05 09:31 pm (UTC)Очень интересно, не знал!
no subject
Date: 2023-12-05 09:39 pm (UTC)no subject
Date: 2023-12-05 11:33 pm (UTC)no subject
Date: 2023-12-06 06:06 am (UTC)no subject
Date: 2023-12-06 03:47 am (UTC)Кроме вирусов (не все вирусы, кстати это могут, а скорее малая часть) еще и бактерии умеют переносить ДНК (например агробактерия - типичный патоген двудольный растений прекрасно умеет переносить часть ДНК из плазмиды, которая у нее, у агробактерии есть и заставлять тем самым растения производить нужные для себя вещества).
Доставка ДНК в клетки при помощи электричества - тоже стандартный лабораторный способ - называется электропорация.
(вообще, кстати, способов доставить ДНК в клетки не так уж и мало, по крайней мере в лабораторных условиях)
no subject
Date: 2023-12-06 06:22 am (UTC)Horizontal Transposon Transfer and Its Implications for the Ancestral Ecology of Hydrophiine Snakes
Transposable elements (TEs), also known as jumping genes, are sequences able to move or copy themselves within a genome. As TEs move throughout genomes they often act as a source of genetic novelty, hence understanding TE evolution within lineages may help in understanding environmental adaptation. Studies into the TE content of lineages of mammals such as bats have uncovered horizontal transposon transfer (HTT) into these lineages, with squamates often also containing the same TEs. Despite the repeated finding of HTT into squamates, little comparative research has examined the evolution of TEs within squamates. Here we examine a diverse family of Australo–Melanesian snakes (Hydrophiinae) to examine if the previously identified, order-wide pattern of variable TE content and activity holds true on a smaller scale. Hydrophiinae diverged from Asian elapids ~30 Mya and have since rapidly diversified into six amphibious, ~60 marine and ~100 terrestrial species that fill a broad range of ecological niches. We find TE diversity and expansion differs between hydrophiines and their Asian relatives and identify multiple HTTs into Hydrophiinae, including three likely transferred into the ancestral hydrophiine from fish. These HTT events provide the first tangible evidence that Hydrophiinae reached Australia from Asia via a marine route.
www.mdpi.com
Horizontal Gene Transfer in Five Parasite Plant Species in Orobanchaceae
Abstract. We sequenced genomes of five parasite species in family Orobanchaceae to explore the evolutionary role of horizontal gene transfer in plants. Orobanch
academic.oup.com
Just a moment...
www.cell.com
"например агробактерия - типичный патоген двудольный растений прекрасно умеет переносить часть ДНК из плазмиды, "
Ну он впрыскивает свою ДНК — а вирусы могут выступать в качестве переносчиков чужой ДНК.
no subject
Date: 2023-12-06 09:49 am (UTC)Во второй статье говорится о горизонтальном переносе ДНК от растений хозяев к растениям паразитам, причем перенос зафиксирован только к облигатным паразитам (которые вообще не фотосинтезируют), а к факультативным нет. Перенос обусловлен в частности тем, что сосудистые системы растения хозяина и паразита связаны, это с натяжкой можно назвать поеданием...
Третья статья пожалуй наиболее соответствует определению съел-приобрел, но и там это называется уникальным/редким событием. (и это вполне соответствует наблюдаемой скорости эволюции, если бы это было так легко, все бы менялось гораздо быстрее)
Все-таки некорректно прямо писать поел -приобрел чужие гены. В первую очередь это характерно все-таки для бактерий, а не для более сложных существ.
Вирусы в естественной среде тоже переносят в первую очередь свою ДНК, а не чужую. У них вообще все очень плотно упаковано - чтобы купить что-то ненужное, надо сначала продать что-то ненужное (Простоквашино) - чтобы перенести что-то чужое, надо сначала от чего-то своего избавиться, иначе в оболочку не поместишься, а выкинув что-то свое можно лишиться какой-то жизненно важной функции. (возможности вирусов переносить гены очень ограничены, даже в лабораторных условиях)
no subject
Date: 2023-12-06 09:54 am (UTC)no subject
Date: 2023-12-06 10:35 am (UTC)Ну вот еще статья о переносе генов от глистов хозяевам (по видимому, птички переварили умерших глистов)
Ancient horizontal transfers of retrotransposons between birds and ancestors of human pathogenic nematodes - Nature Communications
Lymphatic filariasis and loiasis are diseases caused by insect-borne filarial nematodes. Here, Suh et al. identify a retrotransposon that is present in the genomes of these nematodes and seven tropical bird lineages, indicating two waves of horizontal gene transfer around 17–25 million years ago.
www.nature.com
Но да, я согласен, что горизонтальный перенос генов у эукориот — редкое явление.
no subject
Date: 2023-12-06 10:33 am (UTC)"В первой статье про мобильные генетические элементы у змей и их роль в эволюции, но я не увидела прямого указания на горизонтальный перенос генов через поедание"
Three of the four repeats common to all hydrophiines (the hAT, Gypsy and Rex1) appear to have been horizontally transferred in an aquatic environment; with the most similar retrotransposons being identified in a damselfish, eel and a catfish, respectively (Figure 5 (https://www.mdpi.com/2073-4425/13/2/217/htm#fig_body_display_genes-13-00217-f005)). As both eels and catfish are prey of extant sea kraits and sea snakes [55 (https://www.mdpi.com/2073-4425/13/2/217/htm#B55-genes-13-00217),56 (https://www.mdpi.com/2073-4425/13/2/217/htm#B56-genes-13-00217),57 (https://www.mdpi.com/2073-4425/13/2/217/htm#B57-genes-13-00217)], these retrotransposons could have been transferred into the ancestral hydrophiinae from related eels or catfish.
no subject
Date: 2023-12-06 04:41 am (UTC)no subject
Date: 2023-12-06 07:05 am (UTC)Добавлю в пост.
no subject
Date: 2023-12-06 12:12 pm (UTC)Не глядя положил паяльник на АЗС (который контактами вверх) - тряхануло как надо
Думаю что с тех пор станок мутировал и похож на меня :v
no subject
Date: 2023-12-06 12:13 pm (UTC)no subject
Date: 2023-12-08 05:52 pm (UTC)Почему же только въ преступниковъ? И въ жертвъ тоже.