marigranula: (Default)
[personal profile] marigranula
Транспозоны - это внутрегеномные паразиты, зачастую составляющие основную часть генома. Иногда транспозоны кодируют белки напоминающие капсиды вирусов - и в общем, граница между вирусами и транспозонами иногда стирается. В интересном препринте Dueling Endogenous Viral-Like Sequences Control Synaptic Plasticity показывается что два вирусо-подобных транспозона влияют на пластичность синапсов. То есть, эти транспозоны могут влиять на работу мозга и соответственно поведение организма. Это интересный момент, потому что "интересы" транспозонов могут не совпадать с "интересами" хозяина.

Date: 2023-12-23 07:31 pm (UTC)
From: [identity profile] matsea.livejournal.com

Так а почему паразиты? Это "прыгающие" элементы генома - есть мнение, что они двигают эволюцию. В отличие от вируса, они внутри - им не надо размножаться и ускакать. А насчет их интересов - так и интересы мозга иногда не совпадают с интересами печени

Date: 2023-12-23 07:39 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

Они не просто прыгают, они размножаются и их может быть дико много (вот например пример двоякодышащих рыб https://www.nature.com/articles/s41586-021-03198-8 (https://www.nature.com/articles/s41586-021-03198-8)). Без всякого сомнения, транспозоны дают материал, из которого образуются новые гены, но это не отменяет их паразитизм. В конце концов, некоторые гены мы позаимствовали у вирусов — от этого вирусы не перестали быть паразитами.


"интересы мозга иногда не совпадают с интересами печени"


Не, у них общий "интерес" — они же развиваются из одной яйцеклетки.

Date: 2023-12-23 07:46 pm (UTC)
From: [identity profile] genadik.livejournal.com

Интересы хозяина никого не волнуют. Хозяин умрет и только гены могут продолжить существовать. С точки зрения есть только «интересы» генов.

Date: 2023-12-23 07:48 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

Да, конечно. Но они выражаются через печень и мозг. Можно сказать, что моз действует в "интересах" генов

(no subject)

From: [identity profile] antontsau.livejournal.com - Date: 2023-12-24 02:39 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 05:55 am (UTC) - Expand

Date: 2023-12-23 08:12 pm (UTC)
From: [identity profile] matsea.livejournal.com
Про общий интерес мозга и печени скажите пьющим водку :)
Транспозоны остаются в организме — им выгодно чтобы организм жил и размножался. А вирусы в конце концов сбегают — и тогда им уже все равно

Date: 2023-12-23 08:22 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

"Про общий интерес мозга и печени скажите пьющим водку "


Увы, на протяжении всей своей истории, человек не сталкивался с концентрированным алкоголем (первое пиво появилось 13000 лет назад, а более концентрированный алкоголь — еще позже), поэтому мозг и сбивается, когда в организм попадает алкоголь.

(no subject)

From: [identity profile] antontsau.livejournal.com - Date: 2023-12-24 02:41 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 04:38 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] antontsau.livejournal.com - Date: 2023-12-24 05:00 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 05:38 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] solongoj.livejournal.com - Date: 2023-12-24 05:44 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 05:50 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] solongoj.livejournal.com - Date: 2023-12-24 06:02 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 06:35 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] bangor-flying.livejournal.com - Date: 2023-12-24 09:41 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 10:33 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] bangor-flying.livejournal.com - Date: 2023-12-24 01:39 pm (UTC) - Expand

Date: 2023-12-23 07:38 pm (UTC)
From: [identity profile] staerum.livejournal.com

На каком уровне системы можно обнаружить "интересы" у биохимических структур. Интересы мембраны, интересы митохондрий, интересы генов.

Date: 2023-12-23 07:42 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

Можно сказать что у генов и митохондрий (и те и другие способны к воспроизводству) существуют "интересы", которые я все таки ставлю в кавычки.

Date: 2023-12-23 07:44 pm (UTC)
From: [identity profile] staerum.livejournal.com

Способность к размножению или воспроизводству в подходящей среде есть у химических веществ, у кристалов, у гелия в ядрах звёзд. Это даёт им какие-то интересы даже в кавычках?

Date: 2023-12-24 06:31 am (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

Нет разумеется, ведь гелий синтезируется, а не воспроизводится (копируется). Идея "интереса" тесно связанна с эволюцией, и эволюции в звездах не происходит.

(no subject)

From: [identity profile] staerum.livejournal.com - Date: 2023-12-24 09:06 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 11:32 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] staerum.livejournal.com - Date: 2023-12-24 01:43 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 01:52 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] staerum.livejournal.com - Date: 2023-12-24 01:55 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 01:58 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] staerum.livejournal.com - Date: 2023-12-24 02:01 pm (UTC) - Expand

Date: 2023-12-23 07:42 pm (UTC)
From: [identity profile] genadik.livejournal.com

Докинс показывает что интересы генов внутри генома могут не совпадать между собой. Интересы же хозяина вообще никого не волнуют.

Date: 2023-12-23 07:47 pm (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

Ну не совсем так — в случае смерти хозяина, вымрут и его паразиты.

Date: 2023-12-23 09:44 pm (UTC)
From: [identity profile] akm762.livejournal.com
Причём, в отличие от "классических" паразитов, транспозонам светит размножиться только вместе с хозяином; заразить кого-то помимо потомства хозяина они не в состоянии.

Отсюда вывод: "интересы" транспозонов, отличные от интересов их хозяина, могут состоять лишь в том, чтобы сподвигнуть его на размножение, которого он по каким-то причинам не хочет.

Других я придумать не смог.
Edited Date: 2023-12-23 09:44 pm (UTC)

Date: 2023-12-23 11:00 pm (UTC)
From: [identity profile] genadik.livejournal.com

Гены влияют не только на выживания самого хозяина, но и его потомства и даже потомства потомства, и тут начинаются всякие интересные взаимодействия между генами сидящими в разных половых хромосомах.
Классический пример несовпадения интересов разных генов: Х хромосома больше заинтересована в выживании матери, тк мать всегда может родить еще детей, а У хромосома больше заинтересована в выживании ребенка. На практике это приводит к тому что гены Х хромосомы стараются сделать ребенка поменьше (проще родить) а гены У хромосомы стараются сделать ребенка побольше (родить тяжелее, но больше шансов что выживет) на сколько помню, этот пример реальный.

Edited Date: 2023-12-23 11:05 pm (UTC)

(no subject)

From: [identity profile] sverhkabzdets.livejournal.com - Date: 2023-12-24 12:44 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] genadik.livejournal.com - Date: 2023-12-24 06:42 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] sverhkabzdets.livejournal.com - Date: 2023-12-24 11:45 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] twincat.livejournal.com - Date: 2023-12-24 01:01 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 06:29 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] akm762.livejournal.com - Date: 2023-12-24 06:44 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 07:15 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] akm762.livejournal.com - Date: 2023-12-24 08:10 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 08:53 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] akm762.livejournal.com - Date: 2023-12-24 08:59 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 10:54 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] akm762.livejournal.com - Date: 2023-12-24 11:08 am (UTC) - Expand

Date: 2023-12-23 11:43 pm (UTC)
From: [identity profile] olaff67.livejournal.com
В предложенном дискурсе паразитизма мы тоже суть паразиты на теле планеты,

Date: 2023-12-24 04:35 am (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

Ну в этом смысле, вообще все живое — паразиты :)

Date: 2023-12-24 12:50 pm (UTC)
From: [identity profile] olaff67.livejournal.com
Но они единственное из того, что мироздание может противопоставить энтропии.

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 01:43 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] olaff67.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:32 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:36 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] olaff67.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:42 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:44 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] olaff67.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:46 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:53 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] olaff67.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:57 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:58 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] olaff67.livejournal.com - Date: 2023-12-24 03:59 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 04:02 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] olaff67.livejournal.com - Date: 2023-12-24 04:16 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 06:00 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] olaff67.livejournal.com - Date: 2023-12-24 07:07 pm (UTC) - Expand

Date: 2023-12-24 12:50 am (UTC)
From: [identity profile] sverhkabzdets.livejournal.com
Транспозоны это НЕ внутригеномные паразиты. Это участки ДНК организмов, способные к передвижению (транспозиции) и размножению в пределах генома. Транспозоны также известны под названием «прыгающие гены» и являются примерами мобильных генетических элементов.

Транспозоны формально относятся к так называемой некодирующей части генома — той, которая в последовательности пар оснований ДНК не несёт информацию об аминокислотных последовательностях белков. Однако, помимо самой последовательности белков, есть ещё регуляторы их экспрессии, т.е. когда, сколько и где этих аминокислот воспроизвести.

Об этом и статья. Изменение пластичности синапсов. И кстати, никакого "мусорного" или "чужого" генома у вас, кроме как в период болезни от какого-то вируса, нет. "Некодирующая" часть ДНК — это некодирующая именно аминокислотную последовательность, но кодирующая иное.

Date: 2023-12-24 04:36 am (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

"Транспозоны формально относятся к так называемой некодирующей части генома — той, которая в последовательности пар оснований ДНК не несёт информацию об аминокислотных последовательностях белков. "


Нет, многие транспозоны кодируют белки. В частности упоминаемые в статье кодируют — эти белки и влияют на пластичность синапсов.

Date: 2023-12-24 11:46 am (UTC)
From: [identity profile] sverhkabzdets.livejournal.com
"формально".

Date: 2023-12-24 02:37 am (UTC)
From: [identity profile] antontsau.livejournal.com
Да ну нафиг. Обычный треш в памяти, классика работы системы без garbage collectorа. Какой-то вырусь миллион лет назад влез, встроился и сломался, остался зомбипроцесс и все. А иногда не зомби а даже что-то там периодически выплевывающий. Если выплевывает много и сильно говнистого — система дохнет, если редко и безобидного — так и будет там в памяти и копиях болтаться.

Date: 2023-12-24 06:35 am (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

"остался зомбипроцесс и все."


Не все, он же плодится. И у организмов есть то что можно назвать garbage collector. Идет постоянно борьба между размножающимися транспозонами и системами защиты от транспозонов. Причем, если системы защиты отключить, транспозоны начинаются множится со страшной скоростью.


Date: 2023-12-24 06:52 am (UTC)
From: [identity profile] antontsau.livejournal.com

https://en.wikipedia.org/wiki/Zombie_process (https://en.wikipedia.org/wiki/Zombie_process)


труъ зомби процесс уже ничего не делает, система только не может его выкинуть. Он вроде как завершился, не выполняется, но и память не отдал, а значит так и будет там сидеть, копироваться вместе с остальным, сваливаться в своп и прочим образом обрабатываться обычными каналами, но он уже мертв. И если за системой вообще ничто не следит, то такого говна там может образоваться немеряное количество.



(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 07:13 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] antontsau.livejournal.com - Date: 2023-12-24 07:32 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-24 07:54 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] antontsau.livejournal.com - Date: 2023-12-24 08:07 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] marigranula.livejournal.com - Date: 2023-12-25 05:08 am (UTC) - Expand

Date: 2023-12-24 04:37 am (UTC)
From: [identity profile] papa4iter.livejournal.com

ИЧСХ, прочитал пост — китайская грамота. :-)


прочитал комментарии — и даже проникся. прикольная дискуссия.


впрочем, в околофизических кругах так же периодически проскакивает про "интересы электрона" или протона...

Date: 2023-12-24 06:25 am (UTC)
From: [identity profile] marigranula.livejournal.com

Ну да, мы используем метафоры, потому что так легче представить. Разумеется, у генов нет какого-либо интереса — интерес это все таки психологическое понятие, для него нужны мозги...

Profile

marigranula: (Default)
marigranula

March 2026

S M T W T F S
1 2 3 4 5 6 7
8 9 1011121314
15161718192021
22232425262728
293031    

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Mar. 10th, 2026 04:21 pm
Powered by Dreamwidth Studios